Департамент химизации, защиты и карантина растений Министерства водных ресурсов, сельского хозяйства и перерабатывающей промышленности осуществляет постоянный фитосанитарный контроль за саженцами, ввозимыми на территорию страны.

Саженцы относятся к продукции высокого фитосанитарного риска и в обязательном порядке проходят полный карантинный фитосанитарный контроль. В первую очередь проводится документарная проверка, включая наличие фитосанитарного сертификата и соответствие сопроводительных документов. Далее отбираются лабораторные образцы для выявления карантинных вредных организмов. При необходимости проводятся работы по обеззараживанию (фумигации).

В 2024 году в страну было импортировано более 13,3 млн саженцев, в 2025 году — 6,86 млн, что значительно меньше показателей предыдущего года. Объем экспорта саженцев также сократился.

В рамках лабораторного контроля в 2024 году проведено более 8 тысяч экспертиз, в 2025 году — свыше 3 тысяч. В 2025 году объем обеззараживания составил 156 тыс. м³, что существенно превышает показатели 2024 года.

Кроме того, для ввоза саженцев требуется наличие разрешительного документа, подтверждающего право ввоза сортов и гибридов на территорию Кыргызской Республики.

Также в республике осуществляется строгий контроль за оборотом пестицидов и агрохимикатов. Они подлежат обязательной государственной регистрации, а ввоз незарегистрированных химических средств запрещён.

Основная цель деятельности Департамента — защита территории Кыргызской Республики от ввоза и распространения карантинных вредных организмов.